微生物生長所需碳源的不同，反硝化細菌可以分為自養(yǎng)反硝化細菌和異養(yǎng)反硝化細菌，其中大部分反硝化細菌為異養(yǎng)反硝化細菌，它們需要利用有機碳源進行反硝化.。在反硝化過程中有機碳源主要用于異化硝酸鹽還原、同化合成細胞、脫氮或轉化成細胞貯藏碳源，同時異養(yǎng)反硝化細菌生長過程中也需要大量的有機碳源為其提供能量和營養(yǎng)物質。

投加碳源分別為50mg /L。100mg/L，200mg/L條件下，以乙酸鈉作為外加碳源，NO3-N去除率分別為68. 8% ，85.8%.100% ; 葡萄糖作為外加碳源，NO3-N去除率分別為47.3% ，64.3% ，76.2% 以甲醇作為外加碳源，因甲醇需要一定的馴化時間，在初期沒有效果. 因此，乙酸鈉是非常高效的外加碳源. 但對于每天要處理幾萬噸到幾十萬噸的污水處理廠來講，所需費用就十分可觀，因而迫切需要尋找更低成本的外加碳源。